FokI是一种存在于细菌Flavobacterium okeanokoites的type IIS限制酶,含有位于N端的DNA结合区块(N-terminal DNA-binding domain),以及一个位于C端的非专一性DNA切割区块。当此酶与DNA辨识并结合于5'-GGATG-3': 5'-CATCC-3'限制位置(recognition site)时,将会把位于结合位置下游的9到13个核苷酸切除(不需特定序列)。FokI的分子量为65.4 kDA,含有587个氨基酸。
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